Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syngap1F6SEU4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syngap1F6SEU4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms