Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gcn1E9PVA8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gcn1E9PVA8 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gcn1E9PVA8 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Olfr1511-201ENSMUST00000078171 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Olfr1057-201ENSMUST00000099892 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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