Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5478D3Z6R0 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5478D3Z6R0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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