Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms