Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce3B5KM66 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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