Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NhsB1AV60 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms