Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Grik3B1AS29 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms