Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprsB0V2N1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms