Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms