Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm26992S4R1A3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms