Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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CcniQ9Z2V9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CcniQ9Z2V9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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