Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slit3Q9WVB4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms