Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tnnt3Q9QZ47 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tnnt3Q9QZ47 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tnnt3Q9QZ47 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tnnt3Q9QZ47 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Tnnt3Q9QZ47 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tnnt3Q9QZ47 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnt3Q9QZ47 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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