Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms