Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms