Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms