Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmgn5Q9JL35 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms