Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ldb3Q9JKS4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms