Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms