Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms