Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp29Q9ES63 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp29Q9ES63 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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