Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms