Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PudpQ9D5U5 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms