Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms