Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ube2cQ9D1C1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms