Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Zbed3Q9D0L1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Zbed3Q9D0L1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Zbed3Q9D0L1 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Zbed3Q9D0L1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Zbed3Q9D0L1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Zbed3Q9D0L1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Zbed3Q9D0L1 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Zbed3Q9D0L1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Zbed3Q9D0L1 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Zbed3Q9D0L1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Zbed3Q9D0L1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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