Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Mms19Q9D071 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Mms19Q9D071 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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