Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CWU4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9CWU4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms