Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWB5

Pgpep1l, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1lQ9CWB5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Pgpep1lQ9CWB5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pgpep1lQ9CWB5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pgpep1lQ9CWB5 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pgpep1lQ9CWB5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Pgpep1lQ9CWB5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Pgpep1lQ9CWB5 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Pgpep1lQ9CWB5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Pgpep1lQ9CWB5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Pgpep1lQ9CWB5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pgpep1lQ9CWB5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pgpep1lQ9CWB5 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pgpep1lQ9CWB5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pgpep1lQ9CWB5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Pgpep1lQ9CWB5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Pgpep1lQ9CWB5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pgpep1lQ9CWB5 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Pgpep1lQ9CWB5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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