Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Smurf1Q9CUN6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Smurf1Q9CUN6 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Smurf1Q9CUN6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Smurf1Q9CUN6 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Smurf1Q9CUN6 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Smurf1Q9CUN6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Smurf1Q9CUN6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Smurf1Q9CUN6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smurf1Q9CUN6 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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