Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Smim8Q9CQQ0 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms