Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd1Q9CQK7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms