Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rab5aQ9CQD1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rab5aQ9CQD1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rab5aQ9CQD1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rab5aQ9CQD1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rab5aQ9CQD1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Rab5aQ9CQD1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rab5aQ9CQD1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rab5aQ9CQD1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rab5aQ9CQD1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rab5aQ9CQD1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rab5aQ9CQD1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms