Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Chmp3Q9CQ10 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Chmp3Q9CQ10 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Chmp3Q9CQ10 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chmp3Q9CQ10 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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