Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rpl17Q9CPR4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl17Q9CPR4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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