Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
KarsQ99MN1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KarsQ99MN1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms