Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gins4Q99LZ3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms