Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cstf3Q99LI7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms