Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apobec3Q99J72 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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