Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc115Q8VE99 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms