Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4M5

Commd1, COMM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd1Q8K4M5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Commd1Q8K4M5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Commd1Q8K4M5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Commd1Q8K4M5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Commd1Q8K4M5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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