Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms