Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phc3Q8CHP6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms