Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms