Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Usp27Q8CEG8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Usp27Q8CEG8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Usp27Q8CEG8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Usp27Q8CEG8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Usp27Q8CEG8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Usp27Q8CEG8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Usp27Q8CEG8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Usp27Q8CEG8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp27Q8CEG8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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