Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms