Protein–RNA interactions for Protein: Q8C196

Cps1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, mousemouse

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Length 1,500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cps1Q8C196 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cps1Q8C196 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cps1Q8C196 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cps1Q8C196 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cps1Q8C196 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cps1Q8C196 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cps1Q8C196 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cps1Q8C196 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cps1Q8C196 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cps1Q8C196 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cps1Q8C196 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms