Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccser1Q8C0C4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms