Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp1Q8BJQ2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp1Q8BJQ2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp1Q8BJQ2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp1Q8BJQ2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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