Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Atg4bQ8BGE6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Atg4bQ8BGE6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Atg4bQ8BGE6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg4bQ8BGE6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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